Endokrine, Ernährungs- und Stoffwechselkrankheiten (E00-E90)

• Hyper-/Hypoparathyreoidismus (Nebenschilddrüsenüber-/unterfunktion)
• Hyper-/Hypothyreose (Schilddrüsenüber-/unterfunktion)
• Vitamin-D-Mangel

Infektiöse und parasitäre Krankheiten (A00-B99)

• Bakterielle Infektionen (z. B. Borreliose, Yersiniose)

Mund, Ösophagus (Speiseröhre), Magen und Darm (K00-K67; K90-K93)

• Chronisch-entzündliche Darmerkrankungen (CED)
• Zöliakie (gluteninduzierte Enteropathie) – chronische Erkrankung der Dünndarmmukosa (Dünndarmschleimhaut), die auf einer Überempfindlichkeit gegen das Getreideeiweiß Gluten beruht

Muskel-Skelett-System und Bindegewebe (M00-M99)

• Kollagenosen (Gruppe von Bindegewebserkrankungen, die durch Autoimmunprozesse bedingt sind) – systemischer Lupus erythematodes (SLE), Polymyositis (PM) bzw. Dermatomyositis (DM), Sjögren-Syndrom (Sj), Sklerodermie (SSc) und Sharp-Syndrom ("mixed connective tissue disease", MCTD)
• Morbus Bechterew –  chronische entzündliche Erkrankung der Wirbelsäule, die zu einer Gelenksteife (Ankylose) der betroffenen Gelenke führen kann
• Myopathien (Muskelerkrankungen, entzündliche, metabolische,endokrine)
• Myalgie (Muskelschmerzen, toxische, bei Schädigung des ZNS und des peripheren Nervensystems)
• Osteoporose (Knochenschwund)
• Polymyalgia rheumatica – Erkrankung aus dem rheumatischen Formenkreis
• Psoriasisarthritis – Arthritis (entzündliche Gelenkerkrankung) bei Patienten, die an einer Psoriasis (Schuppfenflechte) erkrankt sind 
• Rheumatoide Arthritis (RA) – chronisch entzündliche Multisystemerkrankung, die sich meist in Form einer Synovialitis (Gelenkinnenhautentzündung) manifestiert 
• Sjögren-Syndrom (Gruppe der Sicca-Syndrome) – Autoimmunerkrankung aus der Gruppe der Kollagenosen, die zu einer chronisch entzündlichen Erkrankung der exokrinen Drüsen, am häufigsten der Speichel- und Tränendrüsen, führt; typische Folgeerkrankungen bzw. Komplikationen des Sicca-Syndroms sind:
  
  • Keratokonjunktivitis sicca (Syndrom des trockenen Auges) aufgrund fehlender Benetzung von Horn- und Bindehaut mit Tränenflüssigkeit
  • erhöhte Kariesanfälligkeit durch Xerostomie (Mundtrockenheit) aufgrund verminderter Speichelsekretion
  • Rhinitis sicca (trockene Nasenschleimhäute), Heiserkeit und chronischer Hustenreiz sowie eine gestörte Sexualfunktion durch Störung der Schleimdrüsenproduktion des Respirationstraktes und der Genitalorgane
• Spondyloarthritis – Gruppe entzündlich-rheumatischer Erkrankungen, die vor allem die Gelenke der Wirbelsäule betreffen

Neubildungen – Tumorerkrankungen (C00-D48)

• Tumorerkrankungen, nicht näher bezeichnet

Psyche – Nervensystem (F00-F99; G00-G99)

• Chronisches Müdigkeitssyndrom (Chronic-Fatigue-Syndrom; CFS)
• Depression
• Depressive Pseudodemenz – keine organisch bedingte Demenz, die Ursache für die kognitiven Beeinträchtigungen ist (psychopathologische Altersakzentuierungen der FMS)
• Insomnie (Schlafstörungen) (psychopathologische Altersakzentuierungen der FMS)
• Multiple Sklerose (MS)
• Restless-Legs-Syndrom (Syndrom der ruhelosen Beine)
• Schlafapnoe – Atemaussetzer während des Schlafes die am Tage zur Müdigkeit bis hin zum plötzlichen Einschlafen führen

Symptome und abnorme klinische und Laborbefunde, die anderenorts nicht klassifiziert sind (R00-R99)  

• Fatigue (Müdigkeit)

Medikamente

• Protonenpumpenhemmer (Protonenpumpeninhibitoren, PPI, Säureblocker)
• Statine (Statintherapie mit oder ohne CK-Erhöhung)
• Arthralgie (Gelenkschmerzen) und Myalgie (Muskelschmerzen) unter Aromatasehemmern und Interferonen
• Weitere Medikamente siehe unter "Arzneimittelnebenwirkungen" unter "Schmerzhafte Myopathien durch Medikamente"

Weiteres

• Eosinophilie-Myalgie-Syndrom
• Myofasziales Schmerzsyndrom – Schmerzen in umschriebenen Körperregionen wie zum Beispiel im Schulter-Nacken-Bereich
• Sozialer Rückzug (psychopathologische Altersakzentuierungen der FMS)
• Störungen der Konzentration und Aufmerksamkeit (psychopathologische Altersakzentuierungen der FMS)