Folgende Symptome und Beschwerden können auf eine Hantavirus-Infektion hinweisen:

Symptome des hämorrhagischen Fiebers mit renalem Syndrom (HFRS)

Phase 1

• Hohes Fieber > 38,5 °C (3-4 d)
  
• Schüttelfrost
• Lumbalgie (Rückenschmerzen)
  
• Myalgie (Muskelschmerzen)
  
• Cephalgie (Kopfschmerzen)
• Sehstörungen, passagere
  
• Lichtscheue (Photophobie)
• Konjunktivitis (Bindehautentzündung)
  
• Husten
• Rachenrötung
• Abdominale Schmerzen (Bauchschmerzen)
• Starke, oft kolikartige Flankenschmerzen

Phase 2 (nach ca. 3-6 Tagen)

• Hypotension (niedriger Blutdruck)
  
• konjunktivale Einblutungen (Einblutung der Bindehaut)
  
• Hautpetechien (flohstichartige Blutungen)
  

Phase 3 (Nierenbeteiligung)

• Niereninsuffizienz (Nierenschwäche; Unterfunktion der Nieren)
  
• Mikrohämaturie* (Vorhandensein von Blut im Urin, das per Mikroskop nachzuweisen ist)
  
• Proteinurie* (erhöhte Ausscheidung von Eiweiß mit dem Urin)
• Leukozytose* (Erhöhung der Anzahl der weißen Blutkörperchen)
  
• Kreatinämie* (erhöhte Kreatinwerte im blut)
• Thrombozytopenie* (Mangel an Blutplättchen im Blut)
  
• Urämie (Auftreten harnpflichtiger Substanzen im Blut oberhalb der Normwerte) und Oligo- (weniger als 500 ml Urin in 24 Stunden)/Anurie (weniger als 100 ml Urin in 24 Stunden); akutes Nierenversagen (ANV)
• Schock
  
• extrarenale (außerhalb der Nieren auftretende) Manifestationen (z. B. Beteiligung des ZNS, Begleithepatitis (Begleit-Leberentzündung), Myokarditis (Herzmuskelsentzündung), Thyreoiditis (Schilddrüsenentzündung) Panhypopituitarismus (kompletter Ausfall aller Hormone des Hypophysenvorderlappens)  oder schwere pulmonale Symptome, s. u.)

*Siehe auch Labordiagnostik

Weitere Phasen

• Polyurie (krankhaft erhöhte Urinausscheidung)
  
• Rekonvaleszenz

Man geht davon aus, dass ein großer Teil der Infektionen asymptomatisch verläuft.

Verlauf der Erkrankung durch in Amerika vorkommende Hantaviren

Symptome des Hanta-Virus-induzierten (kardio-) pulmonalen Syndroms (HCPS; Hantavirus pulmonary syndrome, HPS)

Initial

• Akute einsetzendes hohes Fieber
• Myalgie
• Nausea (Übelkeit)/Erbrechen
• Bauchschmerzen
• Vertigo (Schwindel)
• Schwäche

Nach wenigen Tagen

• Hypoxie (Sauerstoffmangel)
  
• Schock
• pulmonales Ödem mit Tachypnoe
• Dyspnoe mit unproduktivem Husten (Atemnot mit (trockenen) Husten ohne Auswurf)
• Interstitielle Pneumonie (Lungenentzündung) mit mononukleären Infiltraten
• ARDS (Acute respiratory distress syndrome) – akutes Lungenversagen im Rahmen eines Multiorganversagens