Erkrankungen, die differentialdiagnostisch bei einer prä- und perinatalen Infektion mit dem Cytomegalievirus in Betracht kommen:

Infektiöse und parasitäre Krankheiten (A00-B99)

• Infektionen mit dem Herpes-simplex-Virus (HSV)
  
• Infektion mit dem Enterovirus
• Röteln
• Sepsis (Blutvergiftung)
• Syphilis (Lues) – sexuell übertragbare Infektionserkrankung
• Toxoplasmose – bakterielle Infektionserkrankung mit dem Erreger Toxoplasma gondii

Erkrankungen, die differentialdiagnostisch bei einer postnatalen Infektion mit dem Cytomegalievirus in Betracht kommen:

Infektiöse und parasitäre Krankheiten (A00-B99)

• Infektion mit dem Epstein-Barr-Virus (EBV)
  

Erkrankungen, die differentialdiagnostisch bei einer Infektion mit dem Cytomegalievirus bei abwehrgeschwächten Personen in Betracht kommen:

Infektiöse und parasitäre Krankheiten (A00-B99)

• Infektionen mit Bakterien, Viren oder Pilzen
• Infektion mit Pneumocystis carinii – Erreger, der zu den Pilzen gezählt wird

Weiteres

• Schäden nach einer Zytostatikatherapie – Medikamente, die bei Krebserkrankungen eingesetzt werden
• Strahlenschäden