Sobald ein Enchondrom Beschwerden verursacht, muss es reseziert werden.

Weitere Indikationen für einen chirurgischen Eingriff sind:

• Stammnahes Enchondrom – Femur (Oberschenkelknochen) und Humerus (Oberarmknochen) – bzw. im Stammskelett gelegenes Enchondrom
  • → Entartungsrisiko
  • → expansiveres Verhalten
  • → Rezidivneigung (Wiederauftreten der Erkrankung)
• Stärkere Schmerzen – Cave: Ruhe- und Nachtschmerzen können ein Hinweis auf maligne (bösartige) Entartung sein!
• Fraktur bzw. Frakturgefahr durch Ausdünnung der Kortikalis (äußere Knochenschicht) 
• Wachstumsverhalten – Weiterwachsen des Enchondroms, obwohl das physiologische Körperwachstum abgeschlossen ist
• Unsichere Abgrenzung zum Chondrosarkom
• Multiples Auftreten von Enchondromen

Methode der Wahl bei den meisten benignen (gutartigen) Knochentumoren ist die intraläsionale Resektion:

• Vorgehensweise: Eröffnung des Tumors → Kürettage → Auffüllung des Knochendefekts mit autologem (vom selben Individuum stammenden) Knochenmaterial (z. B. aus dem Beckenkamm), ggf. Stabilisierung mit metallischen Implantaten (Marknagel, Winkelplatte)