Eine umfassende klinische Untersuchung ist die Grundlage für die Auswahl der weiteren diagnostischen Schritte:

• Allgemeine körperliche Untersuchung – inklusive Blutdruck, Puls, Körpergewicht, Körpergröße; des Weiteren:
  
  • Inspektion (Betrachtung)
    • Haut und Schleimhäute
    • Abdomen
      • Form des Abdomens?
      • Hautfarbe? Hautbeschaffenheit?
      • Effloreszenzen (Hautveränderungen)?
      • Pulsationen? Darmbewegungen?
      • Sichtbare Gefäße?
      • Narben? Hernien (Brüche)?
    • Analregion/Analkanal (Untersuchung in Steinschnittlage; Inspektion des Analbereichs und zudem dabei spreizen der Nates/Gesäßbacken) [Rötung?, Schwellung, Knoten?, Läppchen?, prolabiertes Gewebe?, prallelastischer Knoten perianal (meist stecknadelkopf- bis pflaumengroß), bläulich-rot; am Analrand oder im Analkanal?, Blut?;  Analfissur? (Lokalisation der Analfissur: posteriore Kommissur, d. h. bei 6 Uhr in Steinschnittlage (80 bis 90 % der Fälle):
      • akute Analfissur: Ulkus im Anoderm (Geschwür im Bereich der Analschleimhaut)? (typisch: tropfenförmige, dorsal gelegene Ulkus: 80 % der Fissuren bei 6 Uhr Steinschnittlage, d.h. im Bereich der dorsalen Mittelinie) 
      • chronische bzw. chronifizierte Analfissur: hypertrophe Analpapille (distale Schleimhautausziehungen der Analsäulen)?, Vorpostenfalte bzw. Wächtermariske (perianal/um den Anus herum lokalisierte, schlaffe Hautfalten) distal der Fissur?; Ulkus (Geschwür) mit Randwall?,  fibrosierte Ränder des Ulkus?, ggf  sichtbare Fasern der Sphinktermuskulatur (Muskulatur des Schließmuskels)?; Begleiter der Fissur ist häufig ein Spasmus der Sphinktermuskulatur/Muskulatur des Schließmuskels]
  • Auskultation (Abhören) des Herzens
  • Auskultation der Lunge
  • Palpation (Abtasten) des Abdomens (Bauch) (Druckschmerz?, Klopfschmerz?, Hustenschmerz?, Abwehrspannung?, Bruchpforten?, Nierenlagerklopfschmerz?)
    
  • Digital rektale Untersuchung (DRU): Untersuchung des Rektums (Mastdarm) [Leitsymptome: Schmerzen im Analbereich (vor allem während des Stuhlgangs); Analkrampf; Pruritus (Juckreiz) am After; hellblutige Stuhlauflagerungen; Chronifizierung der Analfissur geht häufig mit einem Spasmus der Sphinktermuskulatur einher]
    [wg. Differentialdiagnosen:
    
    • Analabszess (abgekapselte Eiteransammlung, die sich im Analkanal befindet)
    • Analfistel (abnorme Gangverbindung, die ihren Ursprung im Analkanal hat) → Abklärung eines Morbus Crohn erforderlich; in ca. 40 % der Fälle ist dieses das erste Symptom der Erkrankung
    • Hämorrhoiden
    • Morbus Crohn (chronisch-entzündliche Darmerkrankung; sie verläuft meist in Schüben und kann den gesamten Verdauungstrakt befallen; charakterisierend ist der segmentale Befall der Darmmukosa (Darmschleimhaut), das heißt es können mehrere Darmabschnitte befallen sein, die durch gesunde Abschnitte voneinander getrennt sind)]
• Gesundheitscheck 

In eckigen Klammern [ ] wird auf mögliche pathologische (krankhafte) körperliche Befunde hingewiesen.