Im Folgenden die wichtigsten Erkrankungen bzw. Komplikationen, die durch das West-Nil-Fieber mit bedingt sein können:

Augen und Augenanhangsgebilde (H00-H59)

• Neuritis nervi optici (Optikusneuritis; Sehnervenentzündung)

Herzkreislaufsystem (I00-I99)

• Myokarditis (entzündliche Erkrankung des Herzmuskels) (selten)

Leber, Gallenblase und Gallenwege – Pankreas (Bauchspeicheldrüse) (K70-K77; K80-K87)

• Hepatitis (Leberentzündung) (selten)

Muskel-Skelett-System und Bindegewebe (M00-M99)

• Paralyse (Lähmungserscheinungen)

Psyche – Nervensystem (F00-F99; G00-G99)

• Enzephalitis (Gehirnentzündung) – häufig kommt es zu Spätfolgen (50 % der Fälle); ist bei Personen > 70 Jahre mit einer erhöhten Letalität (Sterblichkeit bezogen auf die Gesamtzahl der an der Krankheit Erkrankten) assoziiert (15-40 %)
• Meningitis (Hirnhautentzündung)
• Polyradikulitis (Entzündung mehrerer Nervenwurzeln)

Symptome und abnorme klinische und Laborbefunde, die anderenorts nicht klassifiziert sind (R00-R99) 

• Ataxie (Gangstörung)