Die Viruswarzen können wie folgt klassifiziert werden:

Ohne Entartungstendenz

• Verruca vulgaris (vulgäre Warze; HPV 1, 2, 3, 4)
• Verruca plantaris (Synonyme: Dornwarze, tiefe Fußsohlenwarze/Fußsohlenwarze, Myrmecia; HPV 1, 4)
• Verruca plana (Flachwarze; HPV 3, 10, 28, 41)
• Mosaikwarzen (HPV 2)
• Filiforme Warzen (dünne, fadenförmige Warzen; HPV 7; häufig bei Metzgern)
• Fokale epitheliale Hyperplasie (HPV 13, 32)
• Konjunktivalpapillome (HPV 6, 11) ‒ Papillome an den Bindehäuten

Mit Entartungstendenz

• Epidermodysplasia verruciformis (EV; Synonym: Lewandowsky-Lutz-Dysplasie; Lutz-Lewandowsky Epidermodysplasia verruciformis; Flachwarzen (HPV 5, 8, 9, 12, 14, 15, 17, 19, 20, 21, 47) – extrem seltene autosomal-rezessive Genodermatose (erbliche Hautkrankheit) 
• Condyloma acuminatum (Synonyme: Spitzenkondylom/Spitzenkondylome, spitze Kondylome, Feigwarze/Feigwarzen, Feuchtwarzen und Genitalwarzen; HPV 6, 11, 40, 42, 43, 44)
• Condyloma planum (flaches Kondylom; HPV 6, 11, 16, 18, 31 etc.)
• Riesenkondylom (HPV 6, 11)
• Laryngxpapillom (6, 11) ‒ Papillome im Bereich des Kehlkopfes
• Bowenoide Papulose (HPV 16, 18)
• Zervikale intraepitheliale Neoplasien (HPV 16, 18, 31, 45)