Eine umfassende klinische Untersuchung ist die Grundlage für die Auswahl der weiteren diagnostischen Schritte:

• Allgemeine körperliche Untersuchung – inklusive Blutdruck, Puls, Körpertemperatur, Körpergewicht, Körpergröße; des Weiteren:
  
  • Inspektion (Betrachtung)
    • Haut, Schleimhäute und Skleren (weiße Teil des Auges)
  • Untersuchung der Lunge (wg. Differentialdiagnose: Pneumonie (Lungenentzündung)):
    
    • Auskultation (Abhören) der Lunge
    • Bronchophonie (Überprüfung der Weiterleitung hochfrequenter Töne; der Patient wird aufgefordert, mehrmals mit spitzer Stimme das Wort "66" auszusprechen, während der Arzt die Lunge abhört)
      [verstärkte Schallleitung durch pulmonale Infiltration/Verdichtung des Lungengewebes (z. B. bei Pneumonie) die Folge ist, die Zahl „66" ist auf der erkrankten Seite besser zu verstehen als auf der gesunden Seite; bei verminderter Schallleitung (abgeschwächt oder fehlend: z. B. bei Pleuraerguss). Die Folge ist, die Zahl "66" ist über der erkrankten Lungenpartie kaum hörbar bis fehlend, da die hochfrequenten Töne stark gedämpft werden]
    • Stimmfremitus (Überprüfung der Weiterleitung tiefer Frequenzen; der Patient wird aufgefordert, mehrmals mit tiefer Stimme das Wort "99" auszusprechen, während der Arzt seine Hände auf den Brustkorb oder Rücken des Patienten legt)
      [verstärkte Schallleitung durch pulmonale Infiltration/Verdichtung des Lungengewebes (z. B. bei Pneumonie) die Folge ist, die Zahl „99" ist auf der erkrankten Seite besser zu verstehen als auf der gesunden Seite; bei verminderter Schallleitung (stark abgeschwächt oder fehlend: bei Pleuraerguss). Die Folge ist, die Zahl "99" ist über der erkrankten Lungenpartie kaum hörbar bis fehlend, da die tieffrequenten Töne stark gedämpft werden]
  • Palpation (Abtasten) des Abdomens (Bauch) (Druckschmerz?, Klopfschmerz?, Hustenschmerz?, Abwehrspannung?, Bruchpforten?, Nierenlagerklopfschmerz?) [wg. Differentialdiagnose: Appendicitis (Blinddarmentzündung)]
    
  • Palpation der Nierenregion [Flankenschmerzen; klopfschmerzhaftes Nierenlager (meist einseitig)]
  • Digital rektale Untersuchung (DRU): Untersuchung des Rektums (Mastdarm) und der angrenzenden Organe mit dem Finger per Palpation: Beurteilung der Prostata in Größe, Form und Konsistenz
    [wg. möglicher Ursachen:
    
    • Benigne Prostatahyperplasie (gutartige Prostatavergrößerung)
    • Chronische Darmentzündungen wie Colitis ulcerosa oder Morbus Crohn (können über den Blutweg (hämatogen) auch zu einer Pyelonephritis führen)]
• Ggf. Krebsvorsorge [wg. möglicher Ursache:
  
  • Plasmozytom  (multiples Myelom) – bösartige Tumorerkrankung aus der Gruppe der Non-Hodgkin-Lymphome. Sein Ursprung liegt wie bei allen Lymphomen im lymphatischen Gewebe; viele (multiple) vom Knochenmark ausgehende Tumoren (Myelome)]
• Ggf. gynäkologische Untersuchung
  [wg. möglicher Ursache:
  
  • Schwangerschaft]]
  [wg. Differentialdiagnose: Adnexitis (Entzündung von Eileiter und Eierstock)]
• Ggf. neurologische Untersuchung [wg. möglicher Ursache: Neurogene Blasenentleerungsstörungen, z. B. aufgrund Multipler Sklerose]
• Urologische/nephrologische Untersuchung
  [wg. möglicher Ursachen:
  
  • Verengungen der Harnröhre
  • Urolithiasis (Harnsteine)
  • Zystitis (Harnblasenentzündung)]
  [wg. Differentialdiagnosen:
  
  • Emphysematöse Pyelonephritis – Form der chronischen Pyelonephritis mit spontaner Gasbildung – durch gasproduzierende Aerobier und fakultative Anaerobier – im Nierenparenchym; sehr selten – tritt praktisch nur bei Diabetikern auf
  • Papillennekrose – Zerstörung der Nierenpapillen mit Ablagerung von Pigment und Schrumpfung des Nierenparenchyms
  • Perirenaler Abszess – abgekapselter Eiteransammlung im die Niere umgebenden Gewebe
  • Renaler Abszess – abgekapselter Eiteransammlung in der Niere
  • Xanthogranulomatöse Pyelonephritis – Sonderform der chronischen Pyelonephritis mit Bildung von Eiter oder Granulomen]

In eckigen Klammern [ ] wird auf mögliche pathologische (krankhafte) körperliche Befunde hingewiesen.