Eine Prostatitis kann entweder urogen – über die Harnorgane –, hämatogen – über das Blut – oder in seltenen Fällen durch das Übergreifen einer Entzündung der Nachbarorgane hervorgerufen werden.
Die Erreger einer bakteriellen Prostatitis sind meist gramnegative Keime wie E. coli oder Klebsiellen.

Urogene Ursachen sind beispielsweise

• Urethrastrikturen – Verengungen der Harnröhre
• Urethradivertikel – Aussackungen der Harnröhre
• Phimose – Vorhautverengung

Auch eine gutartige Prostatavergrößerung – benigne Prostatahypertrophie (BPH) – engt die Harnröhre ein, führt zu Harnabflussstörungen und begünstigt so eine Prostatitis.

Bei einer abakteriellen Prostatitis oder der Prostatodynie lassen sich keine Krankheitserreger nachweisen, obgleich Beschwerden bestehen. Die Ursache der abakteriellen Prostatitis ist noch nicht genau geklärt, evtl. liegt ein sexuell übertragbarer Erreger vor, da diese Form der Prostatitis oft bei jungen, sexuell aktiven Männern auftritt.