Erkrankungen, die differentialdiagnostisch bei einer prä- und perinatalen Infektion mit dem Zytomegalievirus in Betracht kommen

• Syphilis (Lues) – sexuell übertragbare Infektionserkrankung
• Röteln
• Toxoplasmose – bakterielle Infektionserkrankung mit dem Erreger Toxoplasma gondii
  
• Infektionen mit dem Herpes-Simplex-Virus
• Infektion mit dem Enterovirus
• Sepsis (Blutvergiftung)

Erkrankungen, die differentialdiagnostisch bei einer postnatalen Infektion mit dem Zytomegalievirus in Betracht kommen

• Infektion mit dem Epstein-Barr-Virus

Erkrankungen, die differentialdiagnostisch bei einer Infektion mit dem Zytomegalievirus bei abwehrgeschwächten Personen in Betracht kommen

• Infektion mit Pneumocystis carinii – Erreger, der zu den Pilzen gezählt wird
• Infektionen mit Bakterien, Viren oder Pilzen
• Strahlenschäden
• Schäden nach einer Zytostatikatherapie – Medikamente, die bei Krebserkrankungen eingesetzt werden