Im Folgenden die wichtigsten Erkrankungen, die durch Borreliose mit bedingt sein können

Gehirn – Nerven

• Meningitis (Hirnhautentzündung)
• Enzephalitis (Gehirnentzündung)
• Neuritis (Nervenentzündung)
• Ataxie (Gangstörungen)
• Myelitis – Entzündung des Rückenmarks
• Fazialisparese – Lähmung des Gesichtsnerven mit einseitig herunterhängendem Mundwinkel
• Neuropathie (Nervenschäden)
• Chronische Enzephalomyelitis – Entzündung des Gehirns und des Rückenmarks mit Paresen (Lähmungen)
• Enzephalopathie – Gehirnveränderungen, die unter anderem zu Gedächtnisstörungen, Schlafstörungen und zu Störungen der Stimmung führen können
• Schmerzen durch Polyneuropathie (Erkrankung der Nerven des peripheren Nervensystems; je nach Ursache können motorische, sensible oder vegetative Nerven betroffen sein; Sensibilitätsstörungen)

Augen

• Konjunktivitis (Bindehautentzündung)
• Iritis (Regenbogenhautentzündung)
• Vorübergehende Erblindung bei Kindern durch Druck auf den Nervus optikus (Sehnerv)

Herz – Kreislauf

• Herzrhythmusstörungen wie beispielsweise einen Atrioventrikulären Block (AV-Block)
• Chronische Kardiomyopathie – Erkrankung des Herzmuskeln
• Myokarditis (Herzmuskelentzündung)
• Perikarditis (Herzbeutelentzündung)
• Pankarditis – Erkrankung des ganzen Herzens

Atemwege

• Pharyngitis (Rachenentzündung)

Leber

• Hepatitis (Leberentzündung)

Haut

• Lymphadenosis cutis benigna Bäfverstedt – kleine, rötlich bis bläuliche Hautschwellungen (reaktive Hyperplasien lymphatischer Zellen), die vor allem am Ohrläppchen nach einer Borrelieninfektion auftreten können
• Acrodermatitis chronica atrophicans Herxheimer – entzündliche Hauterkrankung der Körperenden mit Ausdünnung der Haut und livider (bläulicher) Verfärbung

Muskel-Skelett-System und Bindegewebe

• Oligoarthritis – Gelenkentzündung mehrerer Gelenke; meist sind große Gelenke wie etwa das Kniegelenk betroffen
• Arthropathie (krankhafte Gelenkveränderungen)